Edgar est une petite taupe qui mène une vie tranquille dans la forêt, allant à l'école avec ses amis pour apprendre la vie. Jusqu'au jour où leur quotidien est perturbé par les humains. Un camion accidenté sur la route la plus proche déversant ses produits chimiques dans la forêt. Edgar et ses amis Abigail et Russell partent alors pour une formidable aventure dans la campagne alentour pour trouver et ramener une fleur seule capable de sauver Michelle, la petite fille de leur professeur, Cornelius, contaminée par les gaz toxiques.